1980年，侯孝贤执导第一部电影作品《就是溜溜的她》，风格显著的长镜头成为他的标签。

1983年执导的《风柜来的人》获1984年法国南特大三洲电影节最佳作品奖、第21届台湾金马奖最佳导演、最佳影片奖提名。

1986年，侯孝贤创作自传式电影《童年往事》。该影片名列影史百大华语电影第三名。

1987年的《恋恋风尘》，虽是一部文艺爱情片却着重写实，并受到许多国际影评及大导演的喜爱、

1989年，1993年，1995年分别执导台湾三部曲：《悲情城市》、《戏梦人生》与《好男好女》奠定了侯孝贤台湾电影大师的地位，并使他闻名海外。

同年，他凭借《悲情城市》获得第46届威尼斯国际电影节主竞赛单元金狮奖。

1998年的作品《海上花》只有不到50个镜头，每个长度达4-8分钟。

2005年，与舒淇、张震合作的电影《最好的时光》入围第58届嘎纳国际电影节主竞赛单元，获得第42届台湾金马奖最佳导演、最佳影片奖提名。

2006年，侯孝贤前往法国拍摄法语电影《红气球之旅》，与法国巨星茱丽叶毕诺许合作。

2015年，侯孝贤凭借《刺客聂隐娘》摘得第68届戛纳电影节最佳导演奖。