1996年，金基德拍摄了自己的第一部电影《鳄鱼藏尸日记》，从此走上了职业电影人的生涯。在此之前，他并没接受过任何有关电影或者美术的正规教育。
影片描述了在大桥底下生活的三个流浪汉——老人、孩子和青年人鳄鱼。影片中的鳄鱼、老人、少女、孩子，每一个人都是被欺凌的边缘人。性和暴力两大元素，也在影片中不断出现。《鳄鱼藏尸日记》是金基德的处女作，由他自筹资金完成。

2001年，金基德凭借动作片《收件人不明》入围威尼斯电影节竞赛单元。影片由罗惠美、杨东根等主演，以70年代美军基地为背景，描写混血儿、“洋公主”和驻韩美军等一群受伤害的人们的故事。
该片获得了第58届威尼斯电影节金狮奖提名，第22届韩国电影青龙奖最佳女配角奖提名和第39届大钟奖最佳女配角奖。

2002年，金基德执导电影《海岸线》。该片由张东健 、朴智娥等主演。这是金基德第一次说服偶像明星张东健出演自己的低成本电影。影片讲述了一心抓住间谍的士兵姜汉泽误杀村民，由此改变了众人命运的故事。该影片也被选为第7届釜山国际电影节开幕电影

2004年，金基德执导电影《撒玛利亚女孩》。影片由李乌、郭芝敏主演，讲述了少女为去欧洲旅行而出卖身体却不幸意外身亡，她的好友决定继续出卖自己的身体为俩人赎罪，以换取内心圣洁的故事。在片中，两个出卖身体的少女，依然保有着纯真的笑容，影片就这样游走在禁忌的边缘，并试图去触碰神圣的高度。该片获得了第54届柏林国际电影节银熊奖。

2004年，金基德执导电影《空房间》。该片由李丞涓、在熙主演，讲述了少妇善花和男孩泰石之间奇特的爱情故事。影片继续着金基德电影的“沉默是金”，男主角没有台词，女主角也只有两句台词。不发一言的男主角，穿梭在主人暂时外出的空房间里，试图在“他人视线所看不到的180度里生活”，他和女主角在别人家做饭、洗衣服的场面具有理所应当的安然气氛只有主人回来时被打破。感情或生活方式上的寄居、逃避乃至选择在《空房间》里得到充分体现。该片获第61届威尼斯国际电影节银狮奖。

2007年，金基德拍摄了以监狱和死囚作为题材的电影《呼吸》，并扮演了一个教导所保安科长。这是金基德为张震量身定做的影片，由张震、朴智娥、河正宇主演。该片真实取景于监狱，选择用死囚将要结束的生命与初生的爱情萌芽作为视角，讲述了一个关于爱和尊严的故事。该片获得了第60届戛纳国际电影节主竞赛单元金棕榈奖提名和入围了第12届釜山国际电影节韩国电影的今天单元。

2011年，金基德拍摄纪录片《阿里郎》，入围第64届戛纳国际电影节“一种关注”单元。该片是金基德自2008年患社交恐惧症离群索居后的第一部作品，讲述导演金基德患社交恐惧症后隐居在一个山间木屋的生活。在一间简陋的山间小屋中，导演金基德为自己准备了一顶帐篷，吃着最简单的食物，取雪作为水饮用。唯一能够证明他身份的是一溜摆放在柜子上的荣誉奖章，其中包括柏林的银熊奖和威尼斯的金狮奖。他人格分裂般地扮演质问者、回答者和旁观者，并在痛哭流涕中说出了无法拍片的原因。影片并无具体故事，编剧、导演、演员、后期制作、主题曲演唱全部由金基德一人完成，加之大量的自问自答和独白，整部影片犹如金基德的一次自我独家专访。

2012年，金基德执导《圣殇》。该片由李廷镇、赵敏秀主演。影片讲述了以追讨高利贷为生的李江道在某天突然遇到了一个声称是他生母的女人，渴望亲情的江道在半信半疑之下和这个女人开始的一段特殊的“母子关系”的故事。片名《圣殇》来源于欧洲文艺复兴时期艺术大师米开朗基罗的同名雕塑。金基德凭借该片获得“年轻评论家奖”、非正式单元的两个奖项和第69届威尼斯国际电影节最佳影片金狮奖。

2013年，金基德执导惊悚片《莫比乌斯》。该片由曹在显、徐英洙主演，讲述一个意外造成儿子致命伤的女人和一个自宫赎罪的男人之间的故事。该片入围了第70届威尼斯电影节。这是金基德继《漂流欲室》、《收件人不详》、《空房间》以及《圣殇》后，第5次收到威尼斯国际电影节的邀请。因含母子性交的乱伦场面，在韩国被评为限制上映级别。

2014年，金基德执导惊悚犯罪片《一对一》。该片由马东锡、金永敏、李伊庚主演。影片讲述一位少女被杀害后，七名市民惩罚导致少女被杀的政府和军方高官的故事。金基德导演意图借影片反映韩国现状，诠释暴力和权力之间的矛盾冲突。片中的女高中生、杀人凶手都影射现实。2015年，该片在第71届威尼斯国际电影节上获得了第11届“威尼斯之日”的最佳影片奖。

2017年，金基德执导新片《人间，空间，时间和人》。该片由藤井美菜、张根硕等主演。该片讲述的是人们搭乘用军舰改造的游轮旅行的途中，船突然开进了意料之外的世界，在暴力、杀戮、性欲的肆虐中展现人类的道德、伦理的界限。通过管理者、骗子、权贵、打手、妓女、外来者、平民，金基德构建了一个较为简单但非常典型的人类社会雏形。“人间”是人类所生活的空间，这个空间里的秩序与规则在一定程度上抑制了人的动物性本能，但这种本能仍然暗流涌动着。于是，在看似一片祥和的环境下，好人与坏人争锋相对，男人与女人纠缠不清。该片已于2018年在柏林电影节首映。