9月16日，中央气象台10时发布台风红色预警，预计台风“山竹”将于16日傍晚前后在广东台山到阳江一带沿海登陆（14-15级，42-48米/秒，强台风级），登陆后将继续向西偏北方向移动，先后穿过广东西部和广西南部，强度逐渐减弱，将于18日前后在广西、云南和贵州交界附近减弱为热带低压。

受台风“山竹”影响，9月16日下午，多个航空公司取消华南地区航班，当地主要机场停运。

广州白云机场发布通知称，根据广州市“三停”工作要求，经与各航空公司研究确定，白云机场从9月16日12:00至24:0017日0:00至08:00期间，所有航班取消。请各位旅客在此期间不要前往机场，并联系所购票航空公司办理退改签手续。 ​​​

深圳宝安机场称，为保障安全，深圳机场9月16日0:00-24:00、9月17日0:00-8:00，暂停所有航班起降，全部航班取消。预计9月17日上午8时后，深圳机场进出港航班将逐步恢复运行。

珠海机场方面，9月16日取消所有进出港航班，9月17日后将视天气情况逐步恢复运行。

目前，香港机场已暂停机场快线及机场巴士服务。机场管理局呼吁旅客前往机场前先向航空公司确定机位及航班时间在启程前往机场。

航空公司在华南地区进出港航班大面积取消。

国航方面，取消9月16日汕头、深圳、惠州、珠海、湛江、海口、三亚进出港的全部航班，取消广州、南宁当日部分航班。

南方航空宣布，9月16日在深圳、珠海、香港进出港航班全部取消，16日12:00后在湛江航班全部取消。16日上午，南航还宣布取消9月16日至17日在广西进出港的16个航班，取消9月16日12:00至24:00，17日0:00-08:00在广州进出港的所有航班。

海南航空方面，截至目前累计取消华南地区进出港航班数量达到575架次。

东方航空和上海航空对9月15日至17日涉及深圳、香港、海口、珠海、南宁、北海、澳门、湛江等地机场的进出港航班做出相应调整。其中，香港16日全天进出港航班取消；珠海16日全天进出港航班取消；澳门16日全天进出港航班取消；深圳16日全天进出港航班取消；广州9月16日12:00至24:00，17日0:00-08:00进出港航班全部取消。

对于已经确定取消的航班，各航空公司均表示将通过短信或电子邮件通知受影响的旅客，同时将为旅客妥善办理客票变更或退票服务。

此外，各大在线旅行平台均发布了旅客保障计划，为预定广州、深圳等地相关度假产品的旅客提供无损失退订或滞留补贴。